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大部分的小兒腦膜炎可以治好，只有一小部分可能會有后遺癥。

小兒腦膜炎可以由病毒、細菌、真菌、支原體、衣原體、結(jié)核桿菌感染引起，大多數(shù)病毒感染性腦炎沒有有效的抗病毒藥物治療，是一個自然過程。輕癥的腦炎預后良好，一般兩周左右即可痊愈，重癥的病毒性腦炎可以存留神經(jīng)系統(tǒng)的后遺癥，甚至死亡。

其中巨細胞病毒感染性腦炎可以應用更昔洛韋治療縮短腦炎的病程；皰疹病毒感染的腦炎可以通過阿昔洛韋治療，可以提高患兒的生存率，皰疹病毒性腦炎預后較差，死亡率高，存活者可以存留神經(jīng)系統(tǒng)后遺癥；細菌性腦炎的預后與感染的致病菌是否對抗生素敏感以及病情嚴重程度有關(guān)。如果病變范圍大，腦組織損害嚴重，細菌對抗生素耐藥，預后較差；支原體腦炎的診斷目前沒有統(tǒng)一標準，治療上主要使用紅霉素和阿奇霉素，大環(huán)內(nèi)酯類抗生素。如果支原體對大環(huán)內(nèi)酯類抗生素產(chǎn)生了耐藥，預后較差；真菌性腦炎如果不治療死亡率是百分之百，規(guī)律的抗真菌治療可提高患兒的生存率，重癥真菌性腦炎預后較差，可存留神經(jīng)系統(tǒng)的后遺癥。真菌性腦炎容易復發(fā)，復發(fā)后需要重新治療，結(jié)核性腦膜炎的預后與感染的結(jié)核菌是否耐藥以及病變的嚴重程度有關(guān)。如果未經(jīng)過規(guī)范化治療，結(jié)核性腦膜炎的預后較差。

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